1. Центральный аппарат
§ Аппарат Председателя Службы безопасности Украины
§ Департамент информационно-аналитического обеспечения (ДІАЗ-укр.)
§ Департамент контрразведки (ДКР)
§ Департамент контрразведывательной защиты экономики государства (ДКЗЕД-укр.)
§ Департамент защиты национальной государственности (ДЗНД-укр.)
§ Департамент оперативно-технических мероприятий (ДОТЗ-укр.)
§ Департамент оперативного документирования (ДОД)
§ Департамент охраны государственной тайны и лицензирования (ДОДТЛ-укр.)
§ Департамент хозяйственного обеспечения (ДГЗ-укр.)
§ Главное управление по борьбе с коррупцией и организованной преступностью (ГУ «К», ГУБКОЗ-укр.) (на правах департамента)
§ Главное следственное управление (ГСУ)
§ Центр специальных операций борьбы с терроризмом, защиты участников уголовного судопроизводства и работников правоохранительных органов (ЦСО «А») (на правах департамента)
§ Управление внутренней безопасности (УВБ)
§ Главная инспекция
§ Управление обеспечения специального оперативного учета (УЗСОО-укр.)
§ Управление работы с личным составом (УРОС-укр.)
§ Управление правового обеспечения (УПЗ-укр.)
§ Управление специальной связи (УСЗ-укр.)
§ Военно-медицинское управление (ВМУ)
§ Служба мобилизации и территориальной обороны (СМТО)
§ Финансово-экономическое управление (ФЕУ-укр.)
§ Управление режима, документального обеспечения и контроля (УРДЗК-укр.)
§ Контрольно-ревизионная инспекция
§ Отдел обеспечения досудебного следствия (ВЗДС-укр.) - изолятор временного содержания при Центральном управлении СБУ (Киев); сектор Отдела в Одесской обл. - изолятор временного содержания при УСБУ в Одесской обл; сектор Отдела в Донецкой обл. - изолятор временного содержания при УСБУ в Донецкой обл.
2. Региональные органы
§ Главное управление Службы безопасности Украины в АР Крым
§ Управление Службы безопасности Украины в городе Киеве
§ Управление Службы безопасности Украины в Киевской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Винницкой области
§ Управление Службы безопасности Украины в Волынской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Днепропетровской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Донецкой области
§ Управление Службы безопасности Украины в Житомирской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Закарпатской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Запорожской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Ивано-Франковской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Кировоградской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Луганской области
§ Управление Службы безопасности Украины во Львовской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Николаевской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Одесской области
§ Управление Службы безопасности Украины Полтавской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Ровенской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Сумской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Тернопольской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Харьковской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Херсонской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Хмельницкой области
§ Управление Службы безопасности Украины в Черкасской области
§ Управление Службы безопасности Украины в Черновицкой области
§ Управление Службы безопасности Украины в Черниговской области
§ Управление Службы безопасности Украины в городе Севастополе.
3.Органы военной контрразведки
§ Управление военной контрразведки Департамента контрразведки (УВКР ДКР)
Подразделения прямого подчинения:
§ Главный отдел УВКР ДКР по Генеральному штабу Вооружённых Сил и Министерству обороны Украины
§ Главный отдел УВКР ДКР по Внутренним войскам Министерства внутренних дел Украины
§ Отдел УВКР ДКР по Государственной пограничной службе Украины
§ Отдел УВКР ДКР по Государственной специальной службе транспорта Министерства инфраструктуры Украины
региональные подразделения:
§ Главный отдел УВКР ДКР в Центральном регионе Украины, Винница (До осени 2011 года - Управление)
§ Главный отдел УВКР ДКР в Южном регионе Украины, Одесса (До осени 2011 года - Управление)
§ Главный отдел УВКР ДКР в Западном регионе Украины, Львов (До осени 2011 года - Управление)
§ Главный отдел УВКР ДКР в Автономной республике Крым и городе Севастополь (До осени 2011 года - Управление)
4. Учебные, научные, научно-исследовательские, и другие учреждения, организации и предприятия:
§ Национальная академия Службы безопасности Украины (НА СБУ-укр.);
§ Институт подготовки юридических кадров для Службы безопасности Украины Национального Университета "Юридическая Академия Украины" им. Ярослава Мудрого (ІПЮК для СБУ-укр.).
§ Отраслевой государственный архив.
§ Украинский научно-исследовательский институт специальной техники и судебных экспертиз Службы безопасности Украины (УкрНДІСТ та СЕ СБ України - укр.) .
§ Другие учреждения, организации, предприятия.
5. Антитеррористический центр при Службе безопасности Украины (АТЦ).
Руководство СБ Украины
§ Председатель СБ Украины — генерал-лейтенант Калинин Игорь Александрович
§ Первый заместитель Председателя — начальник Главного управления по борьбе с коррупцией и организованной преступностью — генерал-лейтенант Рокитский Владимир Георгиевич
§ Заместитель Председателя — генерал-лейтенант Породько Владимир Михайлович